Seboreik keratozun karakteristik klinik görünümü nedeni ile genellikle benzer lezyonlarla ayırıcı tanısında güçlüklerle karşılaşılmaz. Ancak bazen tek bir siyah renkli seboreik keratozlar ile malign melanoma ve pigmente BCC arasında ayırıcı tanının yapılması, özellikle dermatolog olmayanlar için oldukça zor olabilir.