Bipolar radyofrekansta tedavi alanında iki aktif elektrot kullanılmaktadır. Bu uygulama monopolar sistemlere göre daha büyük hacimli doku ısısı sağlamaktadır. Bipolar RF sistemler, ortaya çıkan doku ısısını iki elektrot arasında oluşturmakta ve dokuda dağılmaktadır.

Bipolar sistemlerde elektrotlar eşit ısı yaratacak şekilde tasarlanmıştır. RF akımının dokuda derinliği elektrotların boyutlarına ve elektrotların birbirlerine olan mesafelerine bağlıdır. Elektrotlar arasındaki mesafe azaldığında RF akım yoğunluğu artmaktadır. RF akım yoğunluğu dokuda ısı ile ilişkilidir. Bu nedenle RF'de doku ısısı elektrotlara yakın alanlarda daha fazla, elektrotlardan uzaklaştıkça azalmaktadır. Elektrotlar arasındaki mesafe arttıkça elektrik akımı derinleşmekte ancak akımın dağılımı da artmaktadır. Elektrotlar arasındaki mesafe elektrotların kendi boyutlarından fazla ise, o zaman dokuda gelişen ısı profili bipolar değil, iki ayrı monopolar sistem gibi davranmaktadır.

Bipolar sistemlerde aşağıdakği termal fotoğraf "a" da olduğu gibi gelişen ısı, elektrotların tam altında ve homojen olarak ortaya çıkmaktadır. Dokuda oluşan ısı subnekrotik ısıdır ve deride etki derinliği birkaç mm'nin üzerinde değildir. Subnekrotik ısı, deride kollajenin parçalanmasına ve yeni kollajen yapımı ile derinin yeniden yapılanmasını (remodeling) sağlamaktadır. "b" de ise elektrotlar arasındaki mesafe açıldığı için sistem, bipolardan daha çok monopolar sistem gibi çalışmaktadır. Dokuda ortaya çıkan ısı yine elektrotların ucunda, ancak homojen değildir.

Bipolar sistemlerle yapılan çalışmalarda RF dokuda en iyi akım geometrisi, elektrotlar aktif tedavi alanına paralel yerleştirildiğinde ve elektrotların doku ile temas eden yüzey alanları birbirlerine olan mesafesinden daha fazla olduğunda görülmektedir. Bu bilgiden yola çıkılarak vakumla dokuyu birbirine paralel 2 elektrot arasına alan sistemler geliştirilmiştir. Bu durumda elektrotlar arasındaki ısı daha homojen ve daha yoğundur. Bu sistemlerde dokuda ısı derinliği, elektrotların yüksekliği ile ilişkilidir.

Aşağıdaki termal fotoğrafta 10 mm yüzey boyutlarında 2 elektrot birbirine 10 mm mesafede yerleştirilmiş ve RF uygulaması sonrasında dokuda ısı değişimi görülmektedir. Dokuda ısı, elektrotların arasında 5 mm derinliğe dağılmaktadır. Dokuda ısının derinliği; elektrotlar arasındaki mesafe, elektrot yüzey boyutlarında ya da bundan az ise, ısının derinliği elektrotlar arasındaki mesafenin yarısı kadardır.