Son derece güvenli yapılan ve yan etkilerin en az görüldüğü işlemlerden birisi olmakla birlikte görülen yan etkilerin nedenleri şunlardır;

• Uygulama öncesi ve sonrası hasta prosedürlerinin yapılmaması
• Güneşten korunulmaması
• Hastanın kötü doku iyileşmesi yapısının olması ve bunun uygulama öncesi iyi değerlendirilmemesi
• Doktor hasta değerlendirmesi, kimyasal peeling yöntem seçiminin hatalı yapılması
• Yanlış peeling ajanlarının uygulama alanları dışında kullanılması vb.

Yan Etkiler

• Ödem: Tüm peelingler sonrasında özellikle göz ve ağız çevresinde hafiften şiddetliye ödem gelişebilmektedir. Bu ilk 24-72 saatte ortaya çıkmakta sonra kendiliğinden kaybolmaktadır.
• Ağrı: Uygulama sonrası ilk 24 içerisinde yüzeysel peelinglerde hafif, derin peelinglerde bazen şiddetli ağrı olabilmektedir. Anestezik kremler ve ağrı kesiciler ile bu kontrol altına alınmaktadır.
• Eritem (kızarıklık): Tüm peelingler sonrasında kızarıklık olmakta bunun şiddeti ve süresi peeling derinliğine bağlı olarak değişmektedir. 2-8 hafta arasında tamamen geçmektedir.
• Akne: Peeling uygulaması ve sonrasınada kullanılan yoğun nemlendiriciler sivilce benzeri döküntüler yapabilmektedir ancak bunlar kendiliğinden geçmektedir. Bazen tedavi gerekebilmektedir.
• Enfeksiyon: Peelingte kullanılan asitlerin özelliği nedeni işlem steril olmakta ancak uygulama sonrası cilt bakımında kullanılan yoğun kremler ve pomatlar enfeksiyon gelişimini artırabilmektedir. Antibiyotik kullanımı gerekebilmektedir.
• Herpes (uçuk): Klasik görünen uçuktan farklı olarak su toplamaları değil direkt yaralar ile başlamaktadır. Mutlaka ilaç kullanılmalıdır.
• Renk değişiklikleri: Uygulama sonrası koyuluk yada deri tonunda açılma alanları ortaya çıkabilmektedir.
• Milia: Uygulamadan 2-3 hafta sonra gelişmekte özellikle derinin onarılma ile ortaya çıkmaktadır. Uygulama sonrası kullanılan pomatlarda milia gelişimini arttırmaktadır. Oluşumunda tedavi ile tamamen kaybolmaktadır.
• Demarkasyon hattı: (Peeling yapılan alan ile yapılmayan alan arasında keskin bir sınır oluşmasıdır.) Özellikle derin peelinglerde gözlenmektedir.
• Skar (Kötü yara iyileşmesi): İstenmeyen en ciddi yan etkidir.

Kimyasal maddenin içeriğine bağlı yan etkilerde gelişebilmektedir. Örneğin salisilik asit peelingleri sonrası kulak çınlaması, baş ağrısı ve baş dönmesi gelişebilmektedir.